奏曹掾：掌管上书陈奏。
辞曹掾：掌管诉讼
法曹掾：掌管邮递传送、驿站以及测定里程
尉曹掾：主管士卒刑徒的转运
贼曹掾：掌管捕捉盗贼
决曹掾：主管刑罚审判
兵曹掾：主管军事
金曹掾：主管铸造钱币、盐铁官营
仓曹掾：主管粮食仓储的事物。
黄阁主簿：负责记录、审查诸事。
令史及御属二十三名：
御属：负责太尉的车驾。
阁下令史：掌管府内礼仪事物。
记室令史：掌管各种文书以及陈奏的表章。
门令史：掌管府门。
其他各令史分别掌管诸曹文书。
司徒府
司徒公：简称“司徒”，一人，三公之一，主“人”。光武帝即位时称“大司徒”，建武二十七年，去“大”称“司徒”。建安末，改司徒为“相国”。
职权：
1，执掌百姓事物，凡有关百姓孝悌、恭顺、生老病死的事情，皆要商议并建立制度。
2，负责督导百姓致力与本业，岁末上奏优劣并加以赏罚。
3，国家举行祭祀大典时，负责监察祭祀用的牺牲和清洗祭器。
4，国家大丧时，负责安葬相关的事物。
5，国家有大事时，司空、太尉共同商议对策。
长史一人，千石。掾属三十一名，令史、御属三十六名。
辞曹：掌天下狱讼。
司空府
司空公：简称“司空”，一人，三公之一，主“地”。古官名，秦不置，设御史大夫，汉承秦制。至成帝时，改为“大司空”，哀帝建平二年，改回“御史大夫”，元寿二年，又改回“大司空”。东汉建武二十七年，去“大”称“司空”。献帝建安十三年，罢司空，改回“御史大夫”。后御史大夫郗虑被免职，御史大夫从此不设。
长史一人，千石。掾属二十九名，令史、御属四十二名。
军师祭酒：建安三年，曹操在许县设置，后避司马师讳，称“司空军祭酒”。选通晓法律者担任，负责典察军中刑狱。后，废司空，改属丞相府，称“丞相军祭酒”。
大司马：古官名，汉武帝元狩四年，罢太尉，置“大司马”，用来作为将军的“加官”。安帝地节三年，设置大司马，不用做加官，无印绶，也无官署。成帝绥和元年，初赐大司马金印紫绶，设置官属，禄比丞相。哀帝建平二年，又除去大司马印绶、官属，仍用来作为将军的加官。元寿二年，复赐大司马印绶，置官属，去将军，位在司徒上。东汉建武二十七年，罢“大司马”复置“太尉”。